Deux unités d'hépatologie assurent le soin des patients hospitalisés pour des affections aiguës du foie ou des voies biliaires : cirrhose, hépatopathies virales et chroniques, soins pré- et post-transplantation.

L'une est située au 4ème étage du centre et compte 36 lits d'hospitalisation. La seconde unité, ouverte en juin 2008, est située dans le bâtiment Fred Siguier voisin du Centre Hépato-Biliaire; elle compte 15 lits d'hospitalisation.